Un dia, Kazuki Muto, un muchacho estudiante de secundaria, rescata a una chica de ser devorada por un monstruo pero es apuñalado a muerte por la criatura tras su osadía.

Sin embargo, a la mañana siguiente, descubre que aún sigue vivo. Se pregunta si todo fue un sueño, sin embargo vuelve a encontrarse con el monstruo que lo atacó, dandose cuenta de la realidad sobre su muerte.

El y su hermana intentan huir, en eso, aquella muchacha que Kazuki aparece. Ella le explica que el monstruo es un homúnculo hecho con alquimia ojos, ella tambien le explica que dentro suyo tiene un Kakugane, un objeto hecho con alquimia que ha reemplazado su corazón para que el pueda seguir viviendo, y que tambien le proporcionará la única arma capaz de enfrentarse a los homúnculos.

Op.